Cerita ini gelap, tegang, dan tidak ramah sejak menit awal. Darwin Jihen berpusat pada Charlie, seorang “Half-Human, Half-Chimpanzee” hasil eksperimen ilegal yang dibesarkan sebagai manusia. Meski cerdas, tenang, dan berusaha hidup normal, keberadaan Charlie langsung menabrak realitas dunia yang rasis, takut pada perbedaan, dan haus kekerasan. Kehidupannya berubah ketika ia terseret konflik antara kelompok ekstremis hewan dan manusia yang sama-sama mengklaim kebenaran moral. Anime ini bukan soal siapa yang baik atau jahat, tapi bagaimana ideologi, ketakutan, dan kebencian bisa melahirkan teror atas nama evolusi dan keadilan. Darwin Jihen menyajikan thriller psikologis yang tajam, politis, dan tidak menggurui—memaksa penonton menelan pertanyaan tidak nyaman tentang kemanusiaan, kekerasan, dan batas moral yang perlahan menghilang.