Kaya adalah siswi kecil dengan wajah imut dan sikap polos, namun ia memiliki kemampuan supranatural yang membuat orang dewasa di sekitarnya ketakutan. Ia bisa melihat dan berinteraksi dengan roh, kutukan, serta fenomena aneh yang bagi orang lain terasa mengerikan. Meski dikelilingi hal-hal menyeramkan, Kaya sendiri sama sekali tidak merasa takut dan menjalani hari-harinya dengan tenang seperti anak normal pada umumnya. Kesehariannya dipenuhi kejadian absurd ketika guru, orang dewasa, atau orang asing panik menghadapi fenomena gaib, sementara Kaya justru bersikap santai, bahkan kadang ceria. Ketidakseimbangan reaksi inilah yang menjadi inti cerita, memperlihatkan bagaimana rasa takut sering kali lebih berasal dari persepsi orang dewasa daripada ancaman nyata itu sendiri. Kaya-chan wa Kowakunai adalah horor ringan bercampur komedi dan slice of life. Alih-alih menakut-nakuti, anime ini memanfaatkan suasana menyeramkan sebagai latar untuk cerita hangat dan lucu. Di balik kesan imutnya, cerita ini juga menyentuh tema penerimaan, empati, dan bagaimana anak-anak kerap lebih jujur menghadapi hal-hal yang orang dewasa justru hindari.